合金和密度更高的基體往往更難獲得較低的檢測(cè)水平，因?yàn)闃悠分袝?huì)出現(xiàn)某些現(xiàn)象。在諸如鐵合金等密度較大的材料中，很難獲得低鉛的結(jié)果。其原因是，通常情況下，對(duì)于像鉛這樣的高能元素，基體本身在熒光到達(dá)探測(cè)器之前就吸收了熒光。因此，初始激發(fā)能以高于Fe的能量激發(fā)Fe基中的Pb。然后，這種能量將激發(fā)基體中的鐵，從而使到達(dá)探測(cè)器的鉛熒光減少。有關(guān)這些自吸收現(xiàn)象的更多信息，請(qǐng)參見(jiàn)FP的討論。

這種鉛（或其他微量元素）信號(hào)的吸收很少發(fā)生在像塑料這樣的較輕的基質(zhì)中。在塑料和土壤等低密度基質(zhì)類(lèi)型中，平均穿透深度較大，因此XRF可以看到更多的樣品，并且樣品中較深的信號(hào)更有可能使其返回探測(cè)器。

合金在光譜中也有更多的偽峰，這使得分析更加困難。例如，在12.8keV（Fe K-α+Fe K-α=6.4+6.4keV=12.8keV）處存在Fe和峰（堆積峰）。鉛的L-β峰為12.61keV。軟件會(huì)做減法來(lái)糾正這個(gè)問(wèn)題，但是額外的減法會(huì)增加LOD。